南通市作为中国江苏省的一个重要城市，其医药工业发展迅速。盐酸作为一种常见的化学品，在南通市的医药工业中有着广泛的应用。以下是盐酸在南通市医药工业中的一些主要用途：

1. 药物合成：盐酸是许多药物合成过程中的重要试剂，它可以帮助打开某些有机化合物的环结构，或者用于合成过程中的酸催化反应。

2. 药物提纯：盐酸可以用于药物的提纯和精制过程，通过沉淀、结晶或者离子交换等方法，将药物从复杂的混合物中分离出来。

3. 药品分析：在药品分析过程中，盐酸常作为酸化剂使用，用于调节溶液的pH值，以确保分析方法的准确性和可靠性。

4. 消毒和清洁：盐酸具有很强的腐蚀性，可以用于医药生产车间的消毒和清洁，以防止细菌和病毒的污染。

5. 生物技术：在生物技术中，盐酸可以用于调节细胞培养液的pH值，或者用于蛋白质的分离和纯化。

6. 医疗器械清洗：盐酸可以用于医疗器械的清洗，特别是对于难以清洗的医疗器械，盐酸可以有效去除表面的污垢和残留物。

7. 药物储存：盐酸可以作为某些药物的储存介质，以防止药物分解或被氧化。

8. 研究与开发：在医药工业的研究与开发过程中，盐酸作为一种基本的化学试剂，广泛用于实验研究中的反应条件探索和物质分离。

需要注意的是，尽管盐酸在医药工业中有着重要的作用，但由于其强烈的腐蚀性和毒性，使用时必须严格遵守相关安全规定，确保操作人员的安全和环境的健康。